ANF R POUR LE CALCUL 2024

Europe/Paris
Villa Clythia

Villa Clythia

CAES du CNRS La Villa Clythia 2754, avenue Henri-Giraud 83600 Fréjus
Aymeric Stamm (CNRS), Daphné Giorgi (LPSM - CNRS), Florent Chuffart (INSERM), Pierre Navaro (IRMAR CNRS)
Description

La deuxième édition de l'ANF R POUR LE CALCUL aura lieu du lundi 23 septembre au vendredi 27 septembre à la Villa Clythia à Fréjus.

Le programme comprendra des présentations et travaux pratiques sur les thèmes suivants :

  • Profilage et Optimisation des performances en R
  • Parallélisation
  • Utilisation des clusters de calcul
  • Utilisation de R en calcul haute performance avec les bibliothèques parallel, foreach, doParallel, futureverse
  • Exécution de worflows snakemake sur cluster de calcul
  • Introduction à Rcpp et à son environnement de développement
  • Création de fonctions C++ pour l'analyse de données en R
  • Utilisation des bibliothèques de calcul haute performance avec Rcpp, RcppEigen, RcppArmadillo, RcppGSL, et RcppEnsmallen
  • Introduction à Rmpi et à l'environnement de calcul en cluster
  • Planification de tâches et gestion de ressources avec Slurm
  • Utilisation de OpenMP dans R

Cette ANF s'adresse aux personnes souhaitant tirer profit de serveurs multicoeurs pour leurs programmes R et utiliser des infrastructures de calcul hautes performances.

Les technologies et outils présentés seront (sauf changement de programme de dernière minute) :

Le nombre de places est limité à 30 participants. 

Les inscriptions sont gratuites et ouvertes jusqu'au 15 juin 2024 inclus.

L'hébergement et les repas sont pris en charge par l'ANF. Les stagiaires CNRS pourront demander la prise en charge des frais de déplacement par leur délégation régionale. Des transports collectifs seront organisés entre la gare de Fréjus et la Villa Clythia.

 

  • lundi 23 septembre
    • 14:00 16:00
      futurverse 2h
      Orateur: Aymeric Stamm (Department of Mathematics Jean Leray, UMR CNRS 6629)