ANF NanoBioScopie AFM/FLUO

22 sept. 2026, 13:30 → 24 sept. 2026, 12:40 Europe/Paris

Bordeaux

Avec le soutien de CNRS Physique, le GdR Imabio et le réseau RéMiSoL de la Mission pour les Initiatives Transverses et Interdisciplinaires (MITI) du CNRS organisent une Action Nationale de Formation (ANF) intitulée Nanobioscopie sur les approches corrélatives entre microscopie à force atomique (AFM) et les techniques de microscopies optiques.

 

Cette ANF aura lieu du 22 au 24 septembre 2026 à Bordeaux au sein du laboratoire CBMN (Pessac) et s'adresse à un public divers : utilisateurs de microscopies optiques qui souhaiterait découvrir les possibilités offertes par le couplage avec l'AFM et/ou utilisateurs de la microscopie à sonde locale intéressés par les possibilités de couplage avec différentes techniques de microscopie optique pour l'étude d'échantillons biologiques.

La formation consistera en des cours magistraux sur les techniques et applications ainsi que 3 demi-journées de TP sur des systèmes corrélatifs.

Restauration : 
L'inscription à la formation inclut les 2 repas du midi + le dîner du mercredi.

Hébergement et transport :
L'inscription à la formation n'inclut pas l'hébergement. Plusieurs hôtels sont situés à proximité du lieu de la formation.

• Pour les agents CNRS, les frais de déplacement et d'hébergement sont à la charge de votre délégation régionale.
• Pour les agents non CNRS, ces frais sont à la charge de votre employeur ou du laboratoire.

 

N.B. : Le GT IA de RéMiSoL organise en amont de l'ANF une journée thématique sur l'« IA et l'automatisation dans les microscopies à sonde locale » (JT IA et SPM). Pour ceux qui souhaiteraient coupler leur mission pour y participer, cet événement aura lieu également au CBMN (Pessac) le lundi 21 septembre après-midi et le matin du mardi 22 septembre.

Les inscriptions à l'ANF sont ouvertes jusqu'au 13 juillet 2026

Pour s'inscrire cliquez ici 

Attention, le nombre de participants est limité à 15

mar. 22 septembre

13:30 → 14:20 Accueil des participants

Orateurs: Anthony VIAL, M. Sofiane EL-KIRAT-CHATEL

14:20 → 14:30 Présentation de l’ANF (10m) et tour de table des participants

Orateurs: Anthony VIAL, Sofiane EL-KIRAT-CHATEL

14:30 → 15:00 Microscopies corrélatives pour la biomécanique

Orateur: Sébastien Janel (CNRS)

15:00 → 15:30 De l’imagerie à la mécanobiologie : robotisation de l’AFM par couplage optique et intelligence artificielle

Orateur: Childérick SEVERAC

15:30 → 16:00 Beyond cell surface imaging, correlative AFM-fluorescence to study cell organelles

Orateur: Anthony VIAL

16:00 → 16:20 Pause café

16:20 → 16:50 Confocal-AFM correlative: framework, observables and cross-talk

Orateur: M. Luca COSTA

16:50 → 17:20 AFM-IR : couplage de l’AFM à la spectroscopie infra-rouge pour déterminer la signature biochimique des échantillons

Orateur: Michaël MOLINARI

17:20 → 18:00 Clôture, discussion et diner libre

mer. 23 septembre

08:50 → 09:00 Présentation de la journée

Orateur: Anthony VIAL

09:00 → 09:30 Correlating mechanical information from atomic force microscopy and adhesion and structural information from optical microscopy

Orateur: Claire VALOTTEAU

09:30 → 12:30 Travaux Pratiques 1: Couplage AFM - microscopie TIRF pour l’étude des membranes biologiques

L’objectif de ce TP est d’apprendre à mettre en œuvre le couplage entre l’AFM et la microscopie TIRF (Total Internal Reflection Fluorescence) par la réalisation d’une expérience corrélative AFM/fluorescence. Le TP sera réalisé sur un système AFM Bruker couplé à un microscope inversé équipé d’une illumination TIRF azimutale. Il consistera en l’imagerie AFM et TIRF d’une membrane lipidique modèle fluorescente et abordera les possibilités et contraintes de ce couplage. Les images TIRF seront finalement corrélées à la topographie obtenue en AFM.

Président de session: Anthony VIAL

12:30 → 14:00 Pause déjeuner

14:00 → 17:00 Travaux Pratiques 2: Microscopie corrélative AFM – confocale pour l’étude des propriétés pariétales des micro-algues

L'objectif de ce TP est d'obtenir des images correlatives AFM-confocale de microalgue d'eau douce (Chlorella vulgaris).
Des images AFM de la surface des microalgues seront acquises en mode peak force tapping en condition physiologique. Ainsi les participants pourront tester l'influence des différents paramètres d'imagerie AFM (force d'appui, vitesse de scan, réglages des gains) sur la qualité des images AFM.
Nous étudierons l'influence du temps de croissance sur les propriétés morphologiques des algues.
En parallèles, des images confocales des mêmes cellules seront acquises en microscopie confocale, basées à la fois sur l'auto-fluorescence de ces cellules chlorophylliennes et sur le marquage des différents composés pariétaux des algues par des sondes fluorescentes.

Président de session: Audrey BEAUSSART

19:30 → 22:00 Repas de gala

jeu. 24 septembre

08:50 → 09:00 Présentation de la journée

Orateur: Anthony VIAL

09:00 → 12:00 Travaux Pratiques 3: Construction d’un microscope confocal pour le couplage à un AFM commercial

L’objectif de ce TP est de de construire un microscope confocal basé sur un microscope inversé, pour le couplage à un AFM commercial pour réaliser des mesures corrélatives AFM-fluorescence.
Les étudiants assembleront sur une table optique la voie d’excitation du microscope, qui comprendra une source laser, des miroirs et un système de lentilles permettant de collimater le faisceau dans le plan focal arrière de l’objectif du microscope, pour attendre un faisceau focalisé et diffraction-limited sur l’échantillon. Les étudiants apprendront à aligner les différents éléments optiques. La fluorescence émise par l’échantillon sera collectée par le même objectif puis dirigée vers une voie de détection. Après séparation de l’excitation et de l’émission par des filtres dichroïques, la lumière hors plan focale sera rejetée à l’aide d’un pinhole. Le signal de fluorescence sera ensuite focalisé sur un photodétecteur à avalanche la détection des photons.
L’acquisition des images de fluorescence sera réalisée en gardant le point d’excitation fixe dans l’espace et en déplaçant l’échantillon à l’aide d’une platine motorisée. Dans une seconde étape, les images de fluorescence obtenues seront corrélées avec des images AFM. Selon le temps disponible, cette corrélation sera réalisée soit avec un AFM directement monté sur le microscope inversé, soit avec un AFM installé sur une plateforme distincte.

Président de session: Luca COSTA

12:00 → 12:20 Clôture de la journée et questionnaire de satisfaction

Orateur: Anthony VIAL

12:20 → 12:40 Panier repas